Theo kết quả thanh tra của Thanh tra Chính phủ, một số gói thầu mua sắm trang thiết bị y tế, sinh phẩm, kít xét nghiệm, vaccine,... tại Bộ Y tế và các đơn vị trực thuộc có sai sót, vi phạm về trình tự thủ tục thực hiện, hồ sơ dự thầu, giá trị dự toán.
Qua thanh tra việc mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kít xét nghiệm, vắc xin, thuốc phòng, chống dịch Covid-19 tại Bộ Y tế, Thanh tra Chính phủ cho rằng quy định tại điểm a khoản 1 Điều 22 Luật Đấu thầu là chưa đầy đủ, chưa quy định cụ thể thế nào là 'trường hợp cấp bách' nên khi xảy ra đại dịch chưa có sự nhất quán trong chỉ đạo, hướng dẫn và tổ chức thực hiện.
Sau khi Thanh tra Chính phủ vào cuộc, nhiều nhà thầu các dự án ở Bệnh viện Trung ương Cần Thơ đã xin nộp lại tiền thu lợi hoặc nhận lại thiết bị chưa đạt chuẩn.