Sở NN&PTNT Đà Nẵng đã tiến hành thả phao khoanh vùng bảo vệ nghiêm ngặt các khu vực có rạn san hô quý ở Hòn Sụp, Bãi Bụt, Bãi Nồm,
Từ năm 2010 trở đi, ngoài việc bảo vệ nghiêm ngặt các rạn san hô sẽ triển khai phục hồi hệ sinh thái gần bờ, phát triển đa dạng sinh học, làm giàu nguồn lợi thủy sản tự nhiên, phục vụ phát triển du lịch sinh thái biển, vận động cộng đồng tham gia các hoạt động bảo vệ nguồn tài nguyên quý ở khu vực này.
Rạn san hô ở đây rất đa dạng phong phú. Riêng vùng biển Mũi Nghê đã có 42 loài san hô màu sắc vô cùng ấn tượng. Vùng biển từ Hòn Chảo đến Nam Hải Vân và quanh bán đảo Sơn Trà có 191 loài san hô cứng tạo rạn thuộc 47 giống, 15 họ và 3 giống san hô mềm; 3 loài cỏ biển, 72 loài rong biển, 53 loài động vật thân mềm, 23 loài da gai kích thước lớn, 221 loài thực vật phù du...
Khảo sát trong phạm vi 104 ha cho thấy, chỉ có gần 10% rạn san hô ở tình trạng tốt, còn đến hơn 80% ở tình trạng rất sấu. Đa số rạn san hô vùng này trong tình trạng suy thoái, nguyên nhân chính do sự lắng đọng trầm tích và tình trạng khai thác bừa bãi.
Trước thực trạng đó, chính quyền TP.Đà Nẵng đã quyết định khoanh vùng bảo vệ, khoảng 4.000 ha từ Hòn Chảo đến Nam Hải Vân và quanh bán đảo Sơn Trà. Từ tháng 6/2009 đến nay, ngành chức năng đã bảo vệ nghiêm ngặt gần 100ha thuộc khu vực Hòn Sụp, Bãi Bụt, Hục Lỡ, Vũng Đá và Đông Bãi Bắc từ bờ ra 300m ở độ sâu trung bình 12m.