Cảnh sát và quân đội In-đô-nê-xi-a đã áp dụng những biện pháp tăng cường an ninh tại các khu vực sân bay, nhà ga, bến cảng và bến phà, đồng thời tăng cường giám sát hàng hóa và hành khách qua lại. Cảnh sát cũng đề nghị ban quản lý các khách sạn và trung tâm thương mại thắt chặt kiểm soát an ninh, đồng thời xác nhận các vụ đánh bom ở hai khách sạn JW Marriott và Ritz-Carlton là những vụ đánh bom liều chết. Theo cảnh sát, có thể xác định danh tính kẻ thực hiện vụ đánh bom liều chết tại khách sạn Ritz-Carlton vì phần mặt của hắn vẫn gần như nguyên vẹn, trong khi phần đầu của kẻ đánh bom khách sạn JW Marriott đã bị nát. Tuy nhiên, vẫn có thể xác định nhân thân tên này bằng phương pháp xét nghiệm ADN.
Theo cảnh sát, những quả bom được bọn khủng bố sử dụng đều là loại bom tự chế, làm từ một loại chất nổ màu đen có sức công phá thấp. Những vụ đánh bom trên cho thấy bọn khủng bố đã chuẩn bị công phu trong một thời gian dài. Có thể bọn khủng bố đã thuê và sử dụng một căn phòng tại khách sạn Marriott làm nơi "tập kết" thuốc nổ để chế tạo bom. Hiện chưa có tổ chức nào nhận trách nhiệm về các vụ đánh bom ở Gia-các-ta, nhưng dư luận cho rằng nhiều khả năng vẫn do nhóm khủng bố Giê-ma-a I-xla-mi-a (JI - Jemaah Islamiah) tiến hành.
Trước đó, khoảng hai tuần trước khi bị hành quyết, tên khủng bố I-mam Xa-mu-đra (Imam Samudra), một trong những phần tử JI thực hiện vụ đánh bom tại Ba-li năm 2002, đã "dọa'" sẽ có những vụ đánh bom khủng bố nhằm vào những mục tiêu mới ở In-đô-nê-xi-a sau khi y chết./.