Ngày 31-3-2006, quyết định số 675/QĐ-UBND của UBND tỉnh Ninh Bình về việc thu hồi đất, giao đất để giải phóng mặt bằng xây dựng khu tâm linh chùa Bái Đính tại xã Gia Sinh (huyện Gia Viễn- Ninh Bình) với diện tích 18,8 ha, trong đó chủ yếu là đất rừng của Ban Quản lý rừng phòng hộ huyện Gia Viễn và hơn một ha đất hoang do UBND xã Gia Sinh quản lý giao cho Sở Du lịch (nay là Sở Văn hoá, thể thao và Du lịch Ninh Bình). Trên diện tích đất thu hồi không hề có hộ dân nào phải di dời chỗ ở bởi nơi đây là đất rừng để san ủi xây dựng diện Tam thế.

Tuy nhiên, theo nhu cầu phát triển du lịch để chăm lo việc làm cho người lao động ở xã Gia Sinh nói riêng và huyện Gia Viễn nói chung, ngày 11-9-2006, tại quyết định số 1879/QĐ-UBND của UBND tỉnh Ninh Bình đã phê duyệt quy hoạch chi tiết khu du lịch tâm linh chùa Bái Đính gồm 390 ha. Sau một thời gian ngắn, do lượng khách du lịch trong nước và quốc tế đến khu du lịch Bái Đính ngày càng tấp nập thì với quy mô 390 ha đã bộc lộ những hạn chế, đó là khi di chuyển các pho tượng lớn từ nơi khác trở về (cụ thể là tương Tam thế nặng hàng trăm tấn, chuông, tượng Quan thế âm bồ tát, v.v) cùng với lượng khách đổ về đây tăng gấp bội khiến diện tích 390 ha bị chật cứng không còn chỗ dành cho các công trình vệ sinh, bến xe và nhất là khu tái định cư bố trí quá gần sẽ gây ô nhiễm môi trường, mất vệ sinh khu du lịch. Bên cạnh đó, hồ nước trong khu vực chùa là một phần quan trọng của công trình đảm bảo cảnh quan đẹp, nhưng quan trọng hơn cả là yếu tố tâm linh theo quan niệm của Hội Phật giáo Việt Nam. Đồng thời, tuyến đê Hoàng Long không được bảo vệ dễ gây nguy hiểm cho nhân dân khu vực thùng đấu Quai Thao và Quèn Nghè Hang Trai khi mùa mưa tới.

Tỉnh uỷ, HĐND, UBND tỉnh Ninh Bình đã tổ chức nhiều hội nghị tham khảo ý kiến của các kiến trúc sư trong nước và quốc tế, Hội Phật giáo Việt Nam để quy hoạch khu du lịch tâm linh Tràng An - Bái Đính mang tầm cỡ quốc gia, quốc tế tương xứng với tiềm năng du lịch của  vùng văn hoá cố đô có bề dày hàng nghìn năm lịch sử với tổng diện tích khu du lịch Bái Đính lên 539,2 ha.

Đồng chí Bùi Văn Thắng, Chủ tịch UBND tỉnh Ninh Bình cho biết,  mở rộng quy mô của khu du lịch Bái Đính bởi năm 2008, tại đây đã tổ chức thành công Đại Hội phật giáo Thế giới khiến du khách trong nước và quốc tê tăng mạnh. Năm 2008, Ninh Bình đón hàng triệu lượt người tới tham quan du lịch và 6 tháng năm 2009, Ninh Bình đón gần 1,3 triệu lượt người. Trong những tháng đầu năm 2009, nhiều ngày tại khu du lịch Bái Đính tắc đường kẹt xe hàng cây số. Mỗi ngày riêng điểm chùa Bái Đính đón chừng hàng chục nghìn lượt người. Cho nên việc mở rộng quy hoạch để khu du lịch Bái Đính mang tầm quốc gia, quốc tế là phù hợp với sự phát triển kinh tế - xã hội ở địa phương.

Sau khi tỉnh Ninh Bình có quy hoạch chi tiết khu du lịch Bái Đính - Tràng An, huyện Gia Viễn và xã Gia Sinh tiến hành thông báo cho một số hộ nằm trong vùng quy hoạch tạm dừng xây dựng các công trình, giữ nguyên hiện trạng. Phần lớn những hộ phấn khởi thực hiện nghiêm túc và nhận đất ở khu tái định cư để xây dựng nhà ở. Đáng tiếc, một số ít hộ không chấp hành chủ trương mà còn cơi nới xây dựng công trình quy mô lớn hơn. Không những thế, họ còn ngang nhiên thách thức cơ quan chức năng, thoá mạ cán bộ thi hành công vụ và trong số đó có một vài hộ là đảng viên hiện vẫn đang sinh hoạt tại chi bộ thôn Thuận Phong  thuộc đảng uỷ xã Gia Tiến. Thấy đảng viên không chấp hành, ngoan cố xây cơi nới công trình tại khu vực đã quy hoạch, một số nhà dân cũng bắt chước làm theo.

Lợi ích của việc phát triển du lịch ở khu Tràng An - Bái Đính đối với nhân dân xã Gia Sinh, huyện Gia Viễn và tỉnh Ninh Bình là không thể phủ nhận. Đó là hàng nghìn lao động nông thôn có việc làm, thu nhập ổn định và cao gấp nhiều lần so với nghề nông. Cụ thể như dịch vụ chụp ảnh, xe ôm, chở đò, ăn uống, trông giữ xe.v.v. Còn đối với tỉnh thì nguồn thu ngân sách cũng tăng đáng kể từ ngành công nghiệp không khói này. Việc một số ít gia đình ở Quèn Nghè và khu vực Cầu Đen cố tình chây ỳ, xây dựng trái phép tại khu vực đã quy hoạch cần phải được điều tra, xử lý nghiêm. Đảng uỷ xã Gia Tiến và huyện uỷ Gia Viễn cần làm tốt hơn việc giáo dục đảng viên sống, làm việc theo pháp luật để nhân dân noi theo.