Tại buổi làm việc, UBND tỉnh và các ngành liên quan ở Phú Yên đã kiến nghị những bức xúc xung quanh việc xây dựng quy trình vận hành liên hồ trên dòng sông Ba. Theo quy hoạch đã được phê duyệt, Phú Yên có 18 dự án thủy điện, trong đó có 2 nhà máy đã vận hành, 4 nhà máy đang xây dựng. Bà Trần Thị Hà, Phó chủ tịch UBND tỉnh Phú Yên, cho biết: "Sông Ba là con sông lớn, có lưu vực nằm trên 4 tỉnh Kon Tum, Gia Lai, Đắk Lắk và Phú Yên nên trên sông này cũng như các phụ lưu của nó có nhiều hồ chứa nước thủy điện, thủy lợi. Để giảm thiểu thiệt hại cho vùng hạ lưu khi các hồ thủy điện, thủy lợi xả lũ, cần sớm xây dựng các trạm thủy văn ở lưu vực này, khẩn trương xây dựng quy trình vận hành liên hồ của các hồ chứa nước trong khu vực và quy trình này phải có một cơ quan đủ thẩm quyền điều hành".
Trong khi đó, ông Nghiêm Xuân Bạch, thành viên Đoàn công tác Quốc hội, có ý kiến ngược lại: "Việc ban hành quy trình vận hành liên hồ phụ thuộc vào địa phương, tình hình cụ thể từng địa phương, không nên đợi ở các bộ xây dựng mà tỉnh phải chủ động liên hệ với các bộ để làm việc". Không đồng tình với ý kiến của ông Bạch, bà Trần Thị Hà phản ứng: "Việc phát điện ở các nhà máy như thế nào là do Tập đoàn Điện lực quyết định chứ không phải là địa phương. Vì thế, cấp tỉnh không thể chủ trì trong việc xây dựng quy trình vận hành liên hồ mà phải ở trung ương".
Ông Nghiêm Vũ Khải cho biết riêng hai nhà máy thủy điện sông Ba Hạ và sông Hinh đã mất khoảng 5.000 ha rừng. Vì vậy, tỉnh Phú Yên chỉ đạo và đôn đốc các chủ đầu tư tích cực trồng rừng để đảm bảo độ che phủ rừng đầu nguồn.
Điều đáng lo ngại là đang diễn ra tình trạng thiếu nước cục bộ ở những cánh đồng cuối nguồn hệ thống thủy nông Đồng Cam thuộc các huyện: Phú Hòa, Tây Hòa, Đông Hòa và TP Tuy Hòa. Hiện đã có gần 15.000 ha lúa đông xuân đang làm đòng bị thiếu nước trầm trọng. Nguyên nhân thiếu nước là do việc tích nước của các nhà máy thủy điện ở thượng nguồn.
Theo ông Nghiêm Vũ Khải, Phó chủ nhiệm Ủy ban Khoa học, Công nghệ và Môi trường Quốc hội, phương án sử dụng tài nguyên nước theo khu vực sông không những cho việc phát điện mà cho cả sinh hoạt, sản xuất nông nghiệp. Vấn đề cấp bách là điều tiết chống lũ phải do cơ quan quản lý nhà nước ở trung ương làm đầu mối, các địa phương và các bộ liên quan phối hợp. "Chúng tôi sẽ đề xuất Thủ tướng Chính phủ phê chuẩn quy trình vận hành liên hồ", ông Khải khẳng định.
Ngoài việc kiến nghị cần sớm xây dựng quy trình vận hành liên hồ, các thành viên trong đoàn công tác còn đề xuất thu thuế sử dụng đất đối với phần diện tích sử dụng của nhà máy thủy điện, vì hiện nay Nhà nước chỉ mới thu thuế tài nguyên nước.
Đức Huy