Lê Dụ Tông mất sau đó 2 năm (1731), được an táng, ban đầu là ở làng Cổ Đô, huyện Đông Sơn, Thanh Hóa, về sau được đưa về cải táng tại làng Bái Trạch, huyện Thọ Xuân, Thanh Hóa.
Từ 1958, sau khi được một nông dân phát hiện, thi hài Vua Lê Dụ Tông đã được đưa về Bảo tàng Lịch sử Việt Nam và "di trú" ở đây trong 46 năm. Ngày hôm qua, thi hài Vua Lê Dụ Tông đã được tôn kính rước đưa về hoàn táng tại làng Bái Trạch, huyện Thọ Xuân, Thanh Hóa. Có thể coi những cuộc di hành sau khi mất của Vua Lê Dụ Tông cũng là một phần trong số phận của vị vua này, đồng thời cũng là những long đong của giai đoạn cuối triều Hậu Lê, để sau đó là chiến tranh và loạn lạc.
Có thể vì số phận nhiều bi thương của Vua Lê Dụ Tông đã cảm động không chỉ lòng người Việt mà cả đất trời, nên khi vua được trở về Đất Mẹ Bái Trạch, không chỉ người dân ở Bái Trạch vui lòng nhường đất của mình để xây lăng vua, mà trời quang mây tạnh cũng là một điềm lành cho chuyến "về lại quê nhà" này.
Bây giờ thì lịch sử đã chứng minh Vua Lê Dụ Tông là một ông vua hiền. Suốt thời kỳ tại vị của ông, đất nước ta chủ yếu sống trong cảnh thanh bình. Với thời phong kiến, những năm tháng thanh bình, dù ngắn ngủi, đã là hạnh phúc cho muôn dân rồi.
Sự kính ngưỡng của nhân dân hôm nay với vị vua đã sống cách đây 3 thế kỷ là biểu hiện cho tấm lòng thủy chung như nhất của người Việt luôn nhớ đến nguồn cội của mình. Nhân dân chỉ quên những ai đi ngược lại lợi ích của nhân dân và đất nước, chứ luôn rất phân minh trước những đóng góp dù có thể chưa phải là chói lọi của bất cứ vương triều nào. Miễn là vương triều ấy không bán nước, hại dân.
Vua Lê Dụ Tông, với cuộc đời nhiều long đong bất hạnh của mình, càng được nhân dân ta hôm nay thương xót và kính trọng. Đã tới lúc cần làm sáng tỏ những trang còn mờ trong lịch sử đất nước và dân tộc, để trả lại tuổi tên và sự kính trọng cho những vị vua Việt Nam nào xứng đáng.
Xin cung kính nghiêng mình trước anh linh Vua Lê Dụ Tông!
Thanh Thảo