Cụ thể, mưa lũ đã làm 18 người chết, trong đó, Bắc Kạn: 4 người; Cao Bằng: 3 người; Sơn La và Lai Châu đều có 1 người; Lào Cai: 2 người; Hà Giang: 7 người. Mưa lũ lớn cũng đã làm 11 người mất tích và 3 người khác bị thương.
Thiệt hại về nhà, số nhà bị đổ, trôi gồm 40 nhà, số nhà bị ngập, hư hỏng: 756 nh. Đối với nông nghiệp, theo thống kê đến nay đã có 303ha diện tích lúa bị ngập úng 336ha diện tích hoa màu bị ngập. Về thủy lợi, đã có 495m3 khối lượng đất tại Bắc Kạn bị sạt, trôi, bồi lấp, 1.400m kênh mương tại Lai Chây bị hư hại, 33 công trình thủy lợi nhỏ bị vỡ, hỏng.
Về công tác khắc phục hậu quả mưa, lũ, hiện UBND các tỉnh đã phân công các thành viên BCH đến hiện trường kiểm tra và chỉ đạo các địa phương, ban, ngành thực hiện các biện pháp đối phó và khắc phục hậu quả mưa, lũ.
Thủ Tướng chính phủ Nguyễn Tấn Dũng đã có công điện 1105/CĐ-TTg ngày 06/7/2009 gửi lời thăm hỏi và chia buồn đến các gia đình bị thiệt hại. Để tiếp tục làm tốt công tác đối phó và khắc phục hậu quả do mưa lũ gây ra, Thủ tướng Chính phủ yêu cầu:
Chủ tịch ủy ban nhân dân các tỉnh tiếp tục chỉ đạo các biện pháp cần thiết để chủ động đối phó với tình hình diễn biến lũ trên các triền sông, lũ quét, sạt lở đất, tập trung huy động lực lượng tìm kiếm người mất tích, cứu chữa người bị thương, đảm bảo giao thông, thông tin liên lạc thông suốt, làm tốt công tác vệ sinh môi trường và phòng, chống dịch bệnh, chăm lo hỗ trợ các gia đình bị nạn, chủ động sử dụng ngân sách địa phương và các nguồn tài chính hợp pháp để sớm ổn định đời sống và nhân dân vùng thiên tai.
Các bộ: Giao thông vận tải, Thông tin và Truyền thông, Công thương, Y tế, Quốc phòng, Công an. Nông nghiệp và nông thôn và các Bộ, ngành liên quan có biện pháp giúp đỡ địa phương chống lũ và khắc phục hậu quả, giảm thiểu thiệt hại do mưa lũ gây ra.
Được biết, tại Bắc Kạn, hiện nay các lực lượng cứu hộ cứu nạn của địa phương đã tìm thấy 4 người mất tích (03 người chết trôi và 01 người bị vùi lấp). Công tác tìm kiếm hiện vẫn đang được tiếp tục.